杨浦区企业投资项目备案办理的法律依据包括：

1、《国务院关于投资体制改革的决定》(国发(2004)20号 );

2、国家发展改革委《关于实行企业投资项目备案制的指导意见》(发改投资[2004]2656号);

3、《上海市企业投资项目备案暂行办法》(沪府发[2008]32号)。